本院第一屆董事會成立於民國八十一年十月一日，每一屆董事任期三年，依法連選得連任；民國八十四年十二月十日，舉行董事會，改選董事，第一屆董事會表現卓越，除有三位董事確因公私事務太忙懇辭外，第二屆有十二位獲選連任。仍推選張啟仲先生蟬連董事長。其後第三屆董事人選，變動不多。

　惟張啟仲先生於八十九年初，因年事日高，提請辭董事長，經董事會決議推選梅創辦人接任，已如前述。全體董事一致推請張先生擔任本院「名譽董事長」，經報奉 教育部八十九年六月十四日台（八九）高（二）字第八九○六九九二○號函覆「同意備查」，本院董事會陣容益見堅強。

本院民國九十七年元月起、第六屆董事名單及其職務如下：

　 　　 董 事 長：梅可望 ─ 東海大學榮譽教授、實踐大學榮譽講座

　　　 董 　 事：趙守博 ─ 中華職棒大聯盟董事長

　　 　董 　 事：黃大洲 ─ 華夏投資公司董事長

　　 　董 　 事：楊天生 ─ 長億關係企業董事長

　　 　董 　 事：吳春蘭 ─ 泓品股份有限公司董事長

　　 　董 　 事：陳正郎 ─ 富鼎建設公司董事長

　　 　董 　 事：施宗雄 ─ 東海大學農學院榮譽教授

　　 　董 　 事：黃尊景 ─ 綠邦實業有限公司總經理

　　 　董 　 事：蔡裕慶 ─ 車王股份有限公司董事長兼總經理

　　 　董 　 事：賴信雄 ─ 老虎城購物中心董事長

　　 　董 　 事：賴正鎰 ─ 鄉林建設公司董事長

　　 　董 　 事：黃顯洲 ─ 珞陽建設公司總經理

　　 　董 　 事：陳明德 ─ 中部科學工業園區執行長

　　 　董 　 事：張隆盛 ─ 前環保署長

　　　 董 　 事：江春男 ─ 名政論家

　　 　董 　 事：曾騰光 ─ 朝楊科技大學講座教授

　　　 董 　 事：陳庚金 ─ 前行政院人事行政局局長

　　 　董 　 事：許文聖 ─ 行政院中部辦公室主任

　　 　董 　 事：葉錫東 ─ 國立中興大學副校長

本院董事會成立以來，對院務之指導協助，不遺餘力，對本院工作與財務之監督極為認真。本院在十餘年中能有理想之發展，董事會之貢獻極大。

貳. 本院組織系統表

本院進駐中科後，組織架構調整如下圖所示：
說明：（一）科技研究發展、人文研究服務及教育研究推廣三部門為「虛設」， 其功能為協調，不設專人主持，指定副院長或執行長負協調責任，以增行政效率。 （二）各研究所（中心）負責人已決定，如圖中所示，均一時之選。

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